Instances of tSH-tSH-tHS_kink-turn Motif

             Filename Discrepancy       1       2       3       4       5       6       7       8       9      10      11      12      13        Chains          1-2   1-3   1-4   1-5   1-6   1-7   1-8   1-9  1-10  1-11  1-12  1-13   2-3   2-4   2-5   2-6   2-7   2-8   2-9  2-10  2-11  2-12  2-13   3-4   3-5   3-6   3-7   3-8   3-9  3-10  3-11  3-12  3-13   4-5   4-6   4-7   4-8   4-9  4-10  4-11  4-12  4-13   5-6   5-7   5-8   5-9  5-10  5-11  5-12  5-13   6-7   6-8   6-9  6-10  6-11  6-12  6-13   7-8   7-9  7-10  7-11  7-12  7-13   8-9  8-10  8-11  8-12  8-13  9-10  9-11  9-12  9-13 10-11 10-12 10-13 11-12 11-13 12-13

LIB00007 1        2GIS      0.0000  U   17  G   18  G   19  A   20  G   21  C   31  G   32  A   33  U   34  G   35  A   36  A   37  A   38       AAAAAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s33   tSH   s55   ns35 ----  ----  ----  ----  ----   s33   tSH   ntSH ----   ncsS ----   tSs   s33  ----   tHS   s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSs ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00007 2        2J01      0.3097  U 1234  G 1235  G 1236  A 1237  G 1238  C 1208  G 1209  A 1210  U 1211  G 1212  A 1213  A 1214  G 1215       AAAAAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntSH  tSH   ntSH  s35  ----  ----  ----  ----  ----   s33   ntSH  ntSH ----   ncsS ----   tSs   s35  ----   tHS   s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----  ----  ----  ----  ----   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00007 3        1T0K      0.3335  C    9  G   10  G   11  A   12  G   13  C   54  A   55  G   56  A   57  G   58  A   59  U   60  G   61       CCCCCDDDDDDDD  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntSH  ntSH  s55   ncSH ----  ----  ----  ----  ----   s33   ntSH  ntSH ----   ncsS ----   tSs   s33  ----   tHS   s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----   ntSs ----  ----   s35  ----  ----  ----   ncsS ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00007 4        1S72      0.3548  U 1338  G 1339  G 1340  A 1341  C 1342  G 1312  A 1313  U 1314  G 1315  G 1316  A 1317  A 1318  G 1319       0000000000000  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntSH  tSH   ns55  ncSH ----  ----  ----  ----  ----   s33   tSH   ntSH ----   ncsS ----   tSs   s35  ----   tHS   s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00007 5        2AW4      0.3569  U 1234  G 1235  G 1236  A 1237  G 1238  C 1208  U 1209  G 1210  C 1211  G 1212  A 1213  A 1214  G 1215       BBBBBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntSH  tSH   ntSH  ncSH ----  ----  ----  ----  ----   s33   tSH   ncSW ----   ncsS ----   ntSs  s35  ----   ntHS  s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWH ----  ----  ----  ----  ----  ----   s55  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00007 6        2J01      0.4045  G   81  G   82  G   83  A   84  G   85  C   97  G   98  U   99  G  100  G  102  A  103  U  104  C  105       AAAAAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntSH  ntSH  s55   s35  ----  ----  ----  ----  ----   s33   ntSH  ntSH ----   ncsS ----   tSs   s33  ----   tHS   s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----   tsS  ----  ----   s35  ----  ----  ----   csS  ----  ----  ----  ----  ----   ncSs ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00007 7        1S72      0.4064  G   77  G   78  G   79  A   80  G   81  C   93  G   94  A   95  A   96  G   97  A   98  A   99  C  100       0000000000000  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ntSH  tSH   ns55  ncSH ----  ----  ----  ----  ----   ns33  tSH   ncSW ----   ncsS ----   tSs   s33  ----   tHS   s55  ----  ----   cWW   s55  ----  ----  ----   tsS  ----  ----   s35  ----  ----  ----   ncsS ----  ----   ncSs ----  ----   ncSs ----  ----  ----   s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncSH ----  ----   s35  ----   s35 

View Mutual Discrepancy Graph     View Centroid 2D diagram2D
tSH-tSH-tHS_kink-turn


Return to the Motif Library index
Learn more about basepairs at the Online Basepair Catalog


Download candidates in PDB format
Download FR3D SaveSearch File




Valid HTML 4.01 Transitional Created on 9/14/2008 Questions or comments? Send us an email!