Instances of cWW-tWH-cWW_GAAA-receptor Motif

             Filename Discrepancy       1       2       3       4       5       6       7       8       9      10        Chains       1-2   1-3   1-4   1-5   1-6   1-7   1-8   1-9  1-10   2-3   2-4   2-5   2-6   2-7   2-8   2-9  2-10   3-4   3-5   3-6   3-7   3-8   3-9  3-10   4-5   4-6   4-7   4-8   4-9  4-10   5-6   5-7   5-8   5-9  5-10   6-7   6-8   6-9  6-10   7-8   7-9  7-10   8-9  8-10  9-10

LIB00012 1        1HR2      0.0000  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       AAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH   ncSH  s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 2        1HR2      0.0468  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       BBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH   ncSH  s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 3        1U6B      0.0827  C  146  C  147  U  148  A  149  A  150  G  151  U  160  A  161  G  163  G  164       BBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH   ncSH  s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 4        2R8S      0.0906  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       RRRRRRRRRR  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH   ncSH  s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 5        3BWP      0.1057  C  345  C  346  U  347  A  348  A  349  G  350  U  332  A  333  G  335  G  336       AAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35   ncWH ----  ----   tWH   s55  ----   cSH  ----   s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 6        1GRZ      0.1384  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       AAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----   ns33  tWH   s55  ----  ----   ncSH  s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 7        1GRZ      0.1430  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       BBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   ns35 ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35   ncWH ----   ns33  ntWH  s55  ----  ----  ----   s33   ns55 ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 8        1NBS      0.1448  C  145  C  146  U  147  A  148  C  149  G  150  U  159  A  160  G  162  G  163       BBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   ns55 ----   cSH  ----   s33   ns55 ----  ----   s35   ntHS  ns55 ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 9        1U6B      0.1539  C   60  C   61  U   62  A   63  A   64  G   65  U   80  A   81  G   83  G   84       BBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH  ----   s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 10       1X8W      0.1710  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       CCCCCCCCCC  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   cWW   s35  ----  ----  ----  ----  ----   cWW   s55   s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH  ----   s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 11       1X8W      0.1741  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       DDDDDDDDDD  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   s35   ncWH ----  ----   tWH   s55  ----  ----  ----   s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 12       1X8W      0.1800  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       AAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   ncWW  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55   ncWH ----  ----   ns33  ntWH  s55  ----  ----  ----   s33   ns55 ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 13       1KXK      0.1981  G   14  C   15  U   16  A   17  A   18  G   19  U   54  A   55  G   57  C   58       AAAAAAAAAA  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----   nbif  cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   ns55  s35  ----  ----  ----   tWH   s55  ----   cSH  ----   s33   s55  ----  ----   s35   ntHW  s55  ----  ----   cWW  ----  ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 
LIB00012 14       1X8W      0.2003  C  222  C  223  U  224  A  225  A  226  G  227  U  247  A  248  G  250  G  251       BBBBBBBBBB  s35  ----  ----  ----  ----  ----  ----  ----   cWW   s35  ----  ----  ----  ----   ntWH  cWW   s55  ----  ----  ----   ns33  ntWH  ns55 ----  ----   s35   s33   ns55 ----  ----   s35   ntHW  ns55 ----  ----   cWW   ns55 ----  ----  ----  ----  ----   s35  ----   s35 

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cWW-tWH-cWW_GAAA-receptor


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