6WRS | Motifs

Valid loops

#	loop id	location	annotation	motif
1	HL_6WRS_001 ➜	1/1/67:74	NA	NA
2	HL_6WRS_002 ➜	1/1/87:95	NA	NA
3	HL_6WRS_003 ➜	1/1/122:127	NA	NA
4	HL_6WRS_004 ➜	1/1/136:143	NA	NA
5	HL_6WRS_005 ➜	1/1/158:170	NA	NA
6	HL_6WRS_006 ➜	1/1/197:204	NA	NA
7	HL_6WRS_007 ➜	1/1/228:233	NA	NA
8	HL_6WRS_008 ➜	1/1/249:255	NA	NA
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61	HL_6WRS_067 ➜	1/2/36:42	NA	NA
62	HL_6WRS_068 ➜	1/2/77:92	NA	NA

Problematic loops

#	loop id	Problem	Sequence
1	HL_6WRS_025 ➜	missing nts	NA
2	HL_6WRS_028 ➜	missing nts	NA
3	HL_6WRS_036 ➜	missing nts	NA
4	HL_6WRS_041 ➜	missing nts	NA
5	HL_6WRS_045 ➜	missing nts	NA
6	HL_6WRS_052 ➜	missing nts	NA

Valid loops

#	loop id	location	annotation	motif
1	IL_6WRS_001 ➜	1/1/24:30,1/1/555:561	NA	NA
2	IL_6WRS_002 ➜	1/1/36:37,1/1/488:490	NA	NA
3	IL_6WRS_003 ➜	1/1/42:44,1/1/480:483	NA	NA
4	IL_6WRS_004 ➜	1/1/81:85,1/1/97:104	NA	NA
5	IL_6WRS_005 ➜	1/1/152:153,1/1/175:177	NA	NA
6	IL_6WRS_006 ➜	1/1/186:187,1/1/215:217	NA	NA
7	IL_6WRS_007 ➜	1/1/190:197,1/1/204:212	NA	NA
8	IL_6WRS_008 ➜	1/1/241:248,1/1/256:262	NA	NA
9	IL_6WRS_009 ➜	1/1/328:331,1/1/395:399	NA	NA
10	IL_6WRS_010 ➜	1/1/336:338,1/1/386:390	NA	NA
11	IL_6WRS_011 ➜	1/1/527:530,1/1/541:554	NA	NA
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31	IL_6WRS_031 ➜	1/1/1042:1046,1/1/1197:1201	NA	NA
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36	IL_6WRS_036 ➜	1/1/1075:1078,1/1/1165:1167	NA	NA
37	IL_6WRS_037 ➜	1/1/1081:1083,1/1/1160:1162	NA	NA
38	IL_6WRS_038 ➜	1/1/1235:1237,1/1/1285:1288	NA	NA
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49	IL_6WRS_051 ➜	1/1/1511:1516,1/1/1564:1570	NA	NA
50	IL_6WRS_052 ➜	1/1/1517:1523,1/1/1557:1563	NA	NA
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53	IL_6WRS_055 ➜	1/1/1710:1713,1/1/2020:2021	NA	NA
54	IL_6WRS_056 ➜	1/1/1713:1718,1/1/2017:2020	NA	NA
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57	IL_6WRS_059 ➜	1/1/1796:1798,1/1/2007:2010	NA	NA
58	IL_6WRS_060 ➜	1/1/1825:1831,1/1/1840:1848	NA	NA
59	IL_6WRS_061 ➜	1/1/1864:1867,1/1/1929:1930	NA	NA
60	IL_6WRS_062 ➜	1/1/1867:1869,1/1/1925:1929	NA	NA
61	IL_6WRS_063 ➜	1/1/1873:1876,1/1/1920:1921	NA	NA
62	IL_6WRS_064 ➜	1/1/1878:1882,1/1/1914:1918	NA	NA
63	IL_6WRS_065 ➜	1/1/1883:1887,1/1/1909:1913	NA	NA
64	IL_6WRS_066 ➜	1/1/1891:1894,1/1/1901:1905	NA	NA
65	IL_6WRS_067 ➜	1/1/1960:1961,1/1/1991:1994	NA	NA
66	IL_6WRS_068 ➜	1/1/1961:1972,1/1/1988:1991	NA	NA
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68	IL_6WRS_070 ➜	1/1/2081:2084,1/1/2638:2642	NA	NA
69	IL_6WRS_071 ➜	1/1/2094:2096,1/1/2469:2470	NA	NA
70	IL_6WRS_072 ➜	1/1/2097:2098,1/1/2465:2468	NA	NA
71	IL_6WRS_073 ➜	1/1/2108:2110,1/1/2263:2266	NA	NA
72	IL_6WRS_075 ➜	1/1/2229:2231,1/1/2247:2248	NA	NA
73	IL_6WRS_076 ➜	1/1/2324:2326,1/1/2344:2348	NA	NA
74	IL_6WRS_077 ➜	1/1/2377:2380,1/1/2391:2394	NA	NA
75	IL_6WRS_078 ➜	1/1/2428:2430,1/1/2441:2442	NA	NA
76	IL_6WRS_079 ➜	1/1/2480:2481,1/1/2525:2527	NA	NA
77	IL_6WRS_080 ➜	1/1/2481:2482,1/1/2523:2525	NA	NA
78	IL_6WRS_081 ➜	1/1/2484:2486,1/1/2520:2521	NA	NA
79	IL_6WRS_082 ➜	1/1/2486:2488,1/1/2516:2520	NA	NA
80	IL_6WRS_083 ➜	1/1/2493:2497,1/1/2507:2511	NA	NA
81	IL_6WRS_084 ➜	1/1/2534:2536,1/1/2606:2609	NA	NA
82	IL_6WRS_085 ➜	1/1/2537:2539,1/1/2601:2605	NA	NA
83	IL_6WRS_086 ➜	1/1/2539:2540,1/1/2598:2601	NA	NA
84	IL_6WRS_087 ➜	1/1/2549:2550,1/1/2567:2570	NA	NA
85	IL_6WRS_088 ➜	1/1/2618:2619,1/1/2628:2630	NA	NA
86	IL_6WRS_089 ➜	1/1/2663:2667,1/1/2801:2809	NA	NA
87	IL_6WRS_090 ➜	1/1/2679:2685,1/1/2690:2695	NA	NA
88	IL_6WRS_091 ➜	1/1/2707:2711,1/1/2752:2754	NA	NA
89	IL_6WRS_092 ➜	1/1/2714:2718,1/1/2745:2749	NA	NA
90	IL_6WRS_093 ➜	1/1/2722:2723,1/1/2738:2741	NA	NA
91	IL_6WRS_094 ➜	1/1/2764:2769,1/1/2789:2794	NA	NA
92	IL_6WRS_095 ➜	1/1/2857:2859,1/1/2898:2901	NA	NA
93	IL_6WRS_096 ➜	1/1/2863:2865,1/1/2891:2894	NA	NA
94	IL_6WRS_097 ➜	1/1/2867:2872,1/1/2885:2889	NA	NA
95	IL_6WRS_098 ➜	1/2/15:16,1/2/63:65	NA	NA
96	IL_6WRS_099 ➜	1/2/21:27,1/2/53:58	NA	NA
97	IL_6WRS_100 ➜	1/2/28:30,1/2/48:52	NA	NA
98	IL_6WRS_101 ➜	1/2/32:36,1/2/42:46	NA	NA

Problematic loops

#	loop id	Problem	Sequence
1	IL_6WRS_046 ➜	missing nts	NA
2	IL_6WRS_047 ➜	missing nts	NA
3	IL_6WRS_074 ➜	missing nts	NA

Valid loops

#	loop id	location	annotation	motif
1	J3_6WRS_001 ➜	1/1/30:31,1/1/520:527,1/1/554:555	NA	NA
2	J3_6WRS_002 ➜	1/1/56:67,1/1/74:76,1/1/109:113	NA	NA
3	J3_6WRS_003 ➜	1/1/272:276,1/1/295:302,1/1/415:416	NA	NA
4	J3_6WRS_004 ➜	1/1/728:734,1/1/818:820,1/1/836:839	NA	NA
5	J3_6WRS_005 ➜	1/1/743:745,1/1/777:781,1/1/805:808	NA	NA
6	J3_6WRS_006 ➜	1/1/1335:1340,1/1/1669:1671,1/1/1683:1686	NA	NA
7	J3_6WRS_007 ➜	1/1/1342:1346,1/1/1649:1655,1/1/1664:1667	NA	NA
8	J3_6WRS_008 ➜	1/1/1485:1492,1/1/1506:1511,1/1/1570:1598	NA	NA
9	J3_6WRS_009 ➜	1/1/2117:2120,1/1/2223:2228,1/1/2249:2256	NA	NA
10	J3_6WRS_010 ➜	1/1/2322:2324,1/1/2348:2350,1/1/2359:2364	NA	NA
11	J3_6WRS_011 ➜	1/1/2544:2547,1/1/2572:2574,1/1/2588:2594	NA	NA
12	J3_6WRS_012 ➜	1/1/2834:2835,1/1/2851:2856,1/1/2902:2906	NA	NA

Problematic loops

No problematic loops

6WRS Internal, Hairpin and 3-way Junction Loop Motifs

Valid loops

Problematic loops

Valid loops

Problematic loops

Valid loops

Problematic loops