HL_5ZEY_006
3D structure
- PDB id
- 5ZEY (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
- Description
- M. smegmatis Trans-translation state 70S ribosome
- Experimental method
- ELECTRON MICROSCOPY
- Resolution
- 12.5 Å
Loop
- Sequence
- GCCGGUGCAGGCAAGAGACCACCGUAAGCGUCGUUGCAACCAAUUAAGCGCCGAUUCCAAUCAGCGCGACUACGCCCUCGCUGCCUAAGCGACGGCUGGUCUGUCAGACCGGGAGUGCCCUCGGCCCGGAUCCUGGCAUCAGCUAGAGGGACCCACCCACGGGUUCGGUCGCGGGACCUGUGGGGACAUCAAACAGCGACUGGGAUCGUCAUCUCGGCUUGUUCGUGUGACCGGGAGAUCCGAGUAGAGACAUAGCGAACUGCGC
- Length
- 265 nucleotides
- Bulged bases
- 5ZEY|1|A|G|56, 5ZEY|1|A|A|63, 5ZEY|1|A|C|68, 5ZEY|1|A|G|69, 5ZEY|1|A|U|70, 5ZEY|1|A|A|71, 5ZEY|1|A|A|72, 5ZEY|1|A|G|73, 5ZEY|1|A|A|83, 5ZEY|1|A|A|84, 5ZEY|1|A|C|85, 5ZEY|1|A|C|86, 5ZEY|1|A|A|87, 5ZEY|1|A|A|88, 5ZEY|1|A|U|89, 5ZEY|1|A|U|90, 5ZEY|1|A|G|93, 5ZEY|1|A|C|94, 5ZEY|1|A|A|99, 5ZEY|1|A|C|102, 5ZEY|1|A|C|103, 5ZEY|1|A|C|118, 5ZEY|1|A|G|119, 5ZEY|1|A|C|120, 5ZEY|1|A|U|131, 5ZEY|1|A|A|132, 5ZEY|1|A|G|134, 5ZEY|1|A|C|146, 5ZEY|1|A|U|147, 5ZEY|1|A|C|150, 5ZEY|1|A|A|151, 5ZEY|1|A|C|154, 5ZEY|1|A|G|156, 5ZEY|1|A|G|157, 5ZEY|1|A|C|163, 5ZEY|1|A|C|165, 5ZEY|1|A|G|168, 5ZEY|1|A|G|169, 5ZEY|1|A|C|170, 5ZEY|1|A|A|183, 5ZEY|1|A|G|187, 5ZEY|1|A|U|189, 5ZEY|1|A|G|191, 5ZEY|1|A|A|192, 5ZEY|1|A|G|193, 5ZEY|1|A|G|194, 5ZEY|1|A|G|195, 5ZEY|1|A|A|196, 5ZEY|1|A|C|198, 5ZEY|1|A|C|199, 5ZEY|1|A|C|202, 5ZEY|1|A|G|220, 5ZEY|1|A|G|229, 5ZEY|1|A|G|230, 5ZEY|1|A|A|231, 5ZEY|1|A|C|232, 5ZEY|1|A|A|233, 5ZEY|1|A|A|238, 5ZEY|1|A|C|242, 5ZEY|1|A|C|252, 5ZEY|1|A|U|259, 5ZEY|1|A|U|265, 5ZEY|1|A|G|279, 5ZEY|1|A|A|281, 5ZEY|1|A|G|282, 5ZEY|1|A|A|293, 5ZEY|1|A|G|294, 5ZEY|1|A|A|295, 5ZEY|1|A|C|296, 5ZEY|1|A|A|297, 5ZEY|1|A|A|299, 5ZEY|1|A|G|307, 5ZEY|1|A|C|308
- QA status
- Valid loop
Sequence variability
-
If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.
- R3DSVS
Structural variability across Equivalence Class
-
The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.
- R3DMCS EC
Structural variability across Rfam
-
If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.
- R3DMCS Rfam
- Detailed Annotation
- No text annotation
- Broad Annotation
- No text annotation
- Motif group
- Not in a motif group
- Basepair signature
- Not available
- Number of instances in this motif group
- 0
Unit IDs
5ZEY|1|A|G|46
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- Chain A
- tmRNA
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- Chain B
- Transfer RNA; tRNA
- Chain C
- SsrA-binding protein
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