Loop HL_6GZQ

3D structure

PDB id: 6GZQ (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: T. thermophilus hibernating 70S ribosome
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.28 Å

Loop

Sequence: AGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACU
Length: 52 nucleotides
Bulged bases: 6GZQ|1|A1|U|1126
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

6GZQ|1|A1|A|1102
6GZQ|1|A1|G|1103
6GZQ|1|A1|G|1104
6GZQ|1|A1|A|1105
6GZQ|1|A1|U|1106
6GZQ|1|A1|G|1107
6GZQ|1|A1|U|1108
6GZQ|1|A1|U|1109
6GZQ|1|A1|G|1110
6GZQ|1|A1|G|1111
6GZQ|1|A1|C|1112
6GZQ|1|A1|U|1113
6GZQ|1|A1|U|1114
6GZQ|1|A1|A|1115
6GZQ|1|A1|G|1116
6GZQ|1|A1|A|1117
6GZQ|1|A1|A|1118
6GZQ|1|A1|G|1119
6GZQ|1|A1|C|1120
6GZQ|1|A1|A|1121
6GZQ|1|A1|G|1122
6GZQ|1|A1|C|1123
6GZQ|1|A1|C|1124
6GZQ|1|A1|A|1125
6GZQ|1|A1|U|1126
6GZQ|1|A1|C|1127
6GZQ|1|A1|A|1128
6GZQ|1|A1|U|1129
6GZQ|1|A1|U|1130
6GZQ|1|A1|U|1131
6GZQ|1|A1|A|1132
6GZQ|1|A1|A|1133
6GZQ|1|A1|A|1134
6GZQ|1|A1|G|1135
6GZQ|1|A1|A|1136
6GZQ|1|A1|G|1137
6GZQ|1|A1|U|1138
6GZQ|1|A1|G|1139
6GZQ|1|A1|C|1140
6GZQ|1|A1|G|1141
6GZQ|1|A1|U|1142
6GZQ|1|A1|A|1143
6GZQ|1|A1|A|1144
6GZQ|1|A1|U|1145
6GZQ|1|A1|A|1146
6GZQ|1|A1|G|1147
6GZQ|1|A1|C|1148
6GZQ|1|A1|U|1149
6GZQ|1|A1|C|1150
6GZQ|1|A1|A|1151
6GZQ|1|A1|C|1152
6GZQ|1|A1|U|1153

Current chains

Chain A1: 23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain G1: 50S ribosomal protein L6
Chain e1: 50S ribosomal protein L36

HL_6GZQ_029