Loop HL_6GZQ

3D structure

PDB id: 6GZQ (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: T. thermophilus hibernating 70S ribosome
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.28 Å

Loop

Sequence: GUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCAC
Length: 57 nucleotides
Bulged bases: 6GZQ|1|A1|U|2156, 6GZQ|1|A1|C|2185, 6GZQ|1|A1|U|2191
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

6GZQ|1|A1|G|2145
6GZQ|1|A1|U|2146
6GZQ|1|A1|G|2147
6GZQ|1|A1|G|2148
6GZQ|1|A1|G|2149
6GZQ|1|A1|A|2150
6GZQ|1|A1|G|2151
6GZQ|1|A1|C|2152
6GZQ|1|A1|C|2153
6GZQ|1|A1|U|2154
6GZQ|1|A1|G|2155
6GZQ|1|A1|U|2156
6GZQ|1|A1|G|2157
6GZQ|1|A1|A|2158
6GZQ|1|A1|A|2159
6GZQ|1|A1|C|2160
6GZQ|1|A1|C|2161
6GZQ|1|A1|C|2162
6GZQ|1|A1|C|2163
6GZQ|1|A1|C|2164
6GZQ|1|A1|G|2165
6GZQ|1|A1|C|2166
6GZQ|1|A1|C|2167
6GZQ|1|A1|U|2168
6GZQ|1|A1|C|2169
6GZQ|1|A1|C|2170
6GZQ|1|A1|G|2171
6GZQ|1|A1|G|2172
6GZQ|1|A1|G|2173
6GZQ|1|A1|U|2174
6GZQ|1|A1|G|2175
6GZQ|1|A1|G|2176
6GZQ|1|A1|G|2177
6GZQ|1|A1|G|2178
6GZQ|1|A1|G|2179
6GZQ|1|A1|G|2180
6GZQ|1|A1|G|2181
6GZQ|1|A1|A|2182
6GZQ|1|A1|G|2183
6GZQ|1|A1|G|2184
6GZQ|1|A1|C|2185
6GZQ|1|A1|G|2186
6GZQ|1|A1|C|2187
6GZQ|1|A1|C|2188
6GZQ|1|A1|G|2189
6GZQ|1|A1|G|2190
6GZQ|1|A1|U|2191
6GZQ|1|A1|G|2192
6GZQ|1|A1|A|2193
6GZQ|1|A1|A|2194
6GZQ|1|A1|A|2195
6GZQ|1|A1|U|2196
6GZQ|1|A1|A|2197
6GZQ|1|A1|C|2198
6GZQ|1|A1|C|2199
6GZQ|1|A1|A|2200
6GZQ|1|A1|C|2201

Current chains

Chain A1: 23S ribosomal RNA

Nearby chains

No other chains within 10Å

HL_6GZQ_051