HL_6GZQ_106

3D structure

PDB id

6GZQ (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

T. thermophilus hibernating 70S ribosome

Experimental method

ELECTRON MICROSCOPY

Resolution

3.28 Å

Loop

Sequence

CCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGG

Length

76 nucleotides

Bulged bases

6GZQ|1|A1|C|2132, 6GZQ|1|A1|C|2135, 6GZQ|1|A1|U|2137, 6GZQ|1|A1|G|2140, 6GZQ|1|A1|A|2141, 6GZQ|1|A1|G|2149, 6GZQ|1|A1|A|2150, 6GZQ|1|A1|G|2155, 6GZQ|1|A1|U|2156, 6GZQ|1|A1|G|2183, 6GZQ|1|A1|C|2185, 6GZQ|1|A1|U|2191, 6GZQ|1|A1|A|2193, 6GZQ|1|A1|A|2194, 6GZQ|1|A1|A|2197

QA status

Valid loop

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

6GZQ|1|A1|C|2131
6GZQ|1|A1|C|2132
6GZQ|1|A1|U|2133
6GZQ|1|A1|G|2134
6GZQ|1|A1|C|2135
6GZQ|1|A1|G|2136
6GZQ|1|A1|U|2137
6GZQ|1|A1|A|2138
6GZQ|1|A1|G|2139
6GZQ|1|A1|G|2140
6GZQ|1|A1|A|2141
6GZQ|1|A1|U|2142
6GZQ|1|A1|A|2143
6GZQ|1|A1|G|2144
6GZQ|1|A1|G|2145
6GZQ|1|A1|U|2146
6GZQ|1|A1|G|2147
6GZQ|1|A1|G|2148
6GZQ|1|A1|G|2149
6GZQ|1|A1|A|2150
6GZQ|1|A1|G|2151
6GZQ|1|A1|C|2152
6GZQ|1|A1|C|2153
6GZQ|1|A1|U|2154
6GZQ|1|A1|G|2155
6GZQ|1|A1|U|2156
6GZQ|1|A1|G|2157
6GZQ|1|A1|A|2158
6GZQ|1|A1|A|2159
6GZQ|1|A1|C|2160
6GZQ|1|A1|C|2161
6GZQ|1|A1|C|2162
6GZQ|1|A1|C|2163
6GZQ|1|A1|C|2164
6GZQ|1|A1|G|2165
6GZQ|1|A1|C|2166
6GZQ|1|A1|C|2167
6GZQ|1|A1|U|2168
6GZQ|1|A1|C|2169
6GZQ|1|A1|C|2170
6GZQ|1|A1|G|2171
6GZQ|1|A1|G|2172
6GZQ|1|A1|G|2173
6GZQ|1|A1|U|2174
6GZQ|1|A1|G|2175
6GZQ|1|A1|G|2176
6GZQ|1|A1|G|2177
6GZQ|1|A1|G|2178
6GZQ|1|A1|G|2179
6GZQ|1|A1|G|2180
6GZQ|1|A1|G|2181
6GZQ|1|A1|A|2182
6GZQ|1|A1|G|2183
6GZQ|1|A1|G|2184
6GZQ|1|A1|C|2185
6GZQ|1|A1|G|2186
6GZQ|1|A1|C|2187
6GZQ|1|A1|C|2188
6GZQ|1|A1|G|2189
6GZQ|1|A1|G|2190
6GZQ|1|A1|U|2191
6GZQ|1|A1|G|2192
6GZQ|1|A1|A|2193
6GZQ|1|A1|A|2194
6GZQ|1|A1|A|2195
6GZQ|1|A1|U|2196
6GZQ|1|A1|A|2197
6GZQ|1|A1|C|2198
6GZQ|1|A1|C|2199
6GZQ|1|A1|A|2200
6GZQ|1|A1|C|2201
6GZQ|1|A1|C|2202
6GZQ|1|A1|C|2203
6GZQ|1|A1|U|2204
6GZQ|1|A1|G|2205
6GZQ|1|A1|G|2206

Current chains

Chain A1

23S ribosomal RNA

Nearby chains