IL_8QPP_157

3D structure

PDB id

8QPP (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

Bacillus subtilis MutS2-collided disome complex (stalled 70S)

Experimental method

ELECTRON MICROSCOPY

Resolution

3.4 Å

Loop

Sequence

GGUAGGAGC*GCAUCGGUGGGAUACUACC

Length

28 nucleotides

Bulged bases

8QPP|1|X|G|2194, 8QPP|1|X|G|2195, 8QPP|1|X|G|2198, 8QPP|1|X|A|2200, 8QPP|1|X|U|2201

QA status

Unknown status

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

8QPP|1|X|G|2149
8QPP|1|X|G|2150
8QPP|1|X|U|2151
8QPP|1|X|A|2152
8QPP|1|X|G|2153
8QPP|1|X|G|2154
8QPP|1|X|A|2155
8QPP|1|X|G|2156
8QPP|1|X|C|2157
*
8QPP|1|X|G|2189
8QPP|1|X|C|2190
8QPP|1|X|A|2191
8QPP|1|X|U|2192
8QPP|1|X|C|2193
8QPP|1|X|G|2194
8QPP|1|X|G|2195
8QPP|1|X|U|2196
8QPP|1|X|G|2197
8QPP|1|X|G|2198
8QPP|1|X|G|2199
8QPP|1|X|A|2200
8QPP|1|X|U|2201
8QPP|1|X|A|2202
8QPP|1|X|C|2203
8QPP|1|X|U|2204
8QPP|1|X|A|2205
8QPP|1|X|C|2206
8QPP|1|X|C|2207

Current chains

Chain X

23S ribosomal RNA

Nearby chains