IL_8QPP_194

3D structure

PDB id

8QPP (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

Bacillus subtilis MutS2-collided disome complex (stalled 70S)

Experimental method

ELECTRON MICROSCOPY

Resolution

3.4 Å

Loop

Sequence

GGA*UUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCAC

Length

27 nucleotides

Bulged bases

8QPP|1|X|A|1134, 8QPP|1|X|G|1135, 8QPP|1|X|G|1137

QA status

Unknown status

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

8QPP|1|X|G|1101
8QPP|1|X|G|1102
8QPP|1|X|A|1103
*
8QPP|1|X|U|1127
8QPP|1|X|U|1128
8QPP|1|X|U|1129
8QPP|1|X|A|1130
8QPP|1|X|A|1131
8QPP|1|X|A|1132
8QPP|1|X|G|1133
8QPP|1|X|A|1134
8QPP|1|X|G|1135
8QPP|1|X|U|1136
8QPP|1|X|G|1137
8QPP|1|X|C|1138
8QPP|1|X|G|1139
8QPP|1|X|U|1140
8QPP|1|X|A|1141
8QPP|1|X|A|1142
8QPP|1|X|U|1143
8QPP|1|X|A|1144
8QPP|1|X|G|1145
8QPP|1|X|C|1146
8QPP|1|X|U|1147
8QPP|1|X|C|1148
8QPP|1|X|A|1149
8QPP|1|X|C|1150

Current chains

Chain X

23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain 4

50S ribosomal protein L36

Chain d

Large ribosomal subunit protein uL6