IL_8QPP_197

3D structure

PDB id

8QPP (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

Bacillus subtilis MutS2-collided disome complex (stalled 70S)

Experimental method

ELECTRON MICROSCOPY

Resolution

3.4 Å

Loop

Sequence

CAGCUUGUACAGGAUAG*CCUGGCUG

Length

25 nucleotides

Bulged bases

8QPP|1|X|C|2142, 8QPP|1|X|A|2148, 8QPP|1|X|U|2209

QA status

Unknown status

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

8QPP|1|X|C|2133
8QPP|1|X|A|2134
8QPP|1|X|G|2135
8QPP|1|X|C|2136
8QPP|1|X|U|2137
8QPP|1|X|U|2138
8QPP|1|X|G|2139
8QPP|1|X|U|2140
8QPP|1|X|A|2141
8QPP|1|X|C|2142
8QPP|1|X|A|2143
8QPP|1|X|G|2144
8QPP|1|X|G|2145
8QPP|1|X|A|2146
8QPP|1|X|U|2147
8QPP|1|X|A|2148
8QPP|1|X|G|2149
*
8QPP|1|X|C|2207
8QPP|1|X|C|2208
8QPP|1|X|U|2209
8QPP|1|X|G|2210
8QPP|1|X|G|2211
8QPP|1|X|C|2212
8QPP|1|X|U|2213
8QPP|1|X|G|2214

Current chains

Chain X

23S ribosomal RNA

Nearby chains