Loop J10_8Q4F

3D structure

PDB id: _8Q4 (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description
Experimental method
Resolution

Loop

Sequence: CGACUAAG*UACAAGCAG*CGUAC*GGG*CA*UGAACUC*GUAC*GCGCUG*CC*GG
Length: 48 nucleotides
Bulged bases: 8Q4F|1|a|U|562
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

8Q4F|1|a|C|8
8Q4F|1|a|G|9
8Q4F|1|a|A|10
8Q4F|1|a|C|11
8Q4F|1|a|U|12
8Q4F|1|a|A|13
8Q4F|1|a|A|14
8Q4F|1|a|G|15
*
8Q4F|1|a|U|525
8Q4F|1|a|A|526
8Q4F|1|a|C|527
8Q4F|1|a|A|528
8Q4F|1|a|A|529
8Q4F|1|a|G|530
8Q4F|1|a|C|531
8Q4F|1|a|A|532
8Q4F|1|a|G|533
*
8Q4F|1|a|C|560
8Q4F|1|a|G|561
8Q4F|1|a|U|562
8Q4F|1|a|A|563
8Q4F|1|a|C|564
*
8Q4F|1|a|G|577
8Q4F|1|a|G|578
8Q4F|1|a|G|579
*
8Q4F|1|a|C|1261
8Q4F|1|a|A|1262
*
8Q4F|1|a|U|2017
8Q4F|1|a|G|2018
8Q4F|1|a|A|2019
8Q4F|1|a|A|2020
8Q4F|1|a|C|2021
8Q4F|1|a|U|2022
8Q4F|1|a|C|2023
*
8Q4F|1|a|G|2040
8Q4F|1|a|U|2041
8Q4F|1|a|A|2042
8Q4F|1|a|C|2043
*
8Q4F|1|a|G|2625
8Q4F|1|a|C|2626
8Q4F|1|a|G|2627
8Q4F|1|a|C|2628
8Q4F|1|a|U|2629
8Q4F|1|a|G|2630
*
8Q4F|1|a|C|2788
8Q4F|1|a|C|2789
*
8Q4F|1|a|G|2894
8Q4F|1|a|G|2895

Current chains

Chain a: 23S rRNA

Nearby chains

Chain d: 50S ribosomal protein L3
Chain e: Large ribosomal subunit protein uL4
Chain i: Large ribosomal subunit protein uL13
Chain p: Large ribosomal subunit protein bL20
Chain q: Large ribosomal subunit protein bL21
Chain z: Large ribosomal subunit protein bL32

J10_8Q4F_001