J6_4U26_003

3D structure

PDB id

4U26 (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

Crystal structure of the E. coli ribosome bound to dalfopristin and quinupristin.

Experimental method

X-RAY DIFFRACTION

Resolution

2.8 Å

Loop

Sequence

GG*CGAACC*GAGGAAAAGAAAU*AGAUU*AGCAGC*GCUAAAUAC

Length

41 nucleotides

Bulged bases

4U26|1|DA|A|223

QA status

Valid loop

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

4U26|1|DA|G|45
4U26|1|DA|G|46
*
4U26|1|DA|C|179
4U26|1|DA|G|180
4U26|1|DA|A|181
4U26|1|DA|A|182
4U26|1|DA|C|183
4U26|1|DA|C|184
*
4U26|1|DA|G|212
4U26|1|DA|A|213
4U26|1|DA|G|214
4U26|1|DA|G|215
4U26|1|DA|A|216
4U26|1|DA|A|217
4U26|1|DA|A|218
4U26|1|DA|A|219
4U26|1|DA|G|220
4U26|1|DA|A|221
4U26|1|DA|A|222
4U26|1|DA|A|223
4U26|1|DA|U|224
*
4U26|1|DA|A|231
4U26|1|DA|G|232
4U26|1|DA|A|233
4U26|1|DA|U|234
4U26|1|DA|U|235
*
4U26|1|DA|A|262
4U26|1|DA|G|263
4U26|1|DA|C|264
4U26|1|DA|A|265
4U26|1|DA|G|266
4U26|1|DA|C|267
*
4U26|1|DA|G|425
4U26|1|DA|C|426
4U26|1|DA|U|427
4U26|1|DA|A|428
4U26|1|DA|A|429
4U26|1|DA|A|430
4U26|1|DA|U|431
4U26|1|DA|A|432
4U26|1|DA|C|433

Current chains

Chain DA

23S rRNA

Nearby chains

Chain D2

50S ribosomal protein L34