Loop J6_4V5G

3D structure

PDB id: 4V5G (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: The crystal structure of the 70S ribosome bound to EF-Tu and tRNA
Experimental method: X-RAY DIFFRACTION
Resolution: 3.6 Å

Loop

Sequence: CGAAAU*AG*UGAG*CGAGCGCGGGAACAACCGAGAC*GG*CGGUAG
Length: 42 nucleotides
Bulged bases: 4V5G|1|DA|A|945, 4V5G|1|DA|C|975
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

4V5G|1|DA|C|817
4V5G|1|DA|G|818
4V5G|1|DA|A|819
4V5G|1|DA|A|820
4V5G|1|DA|A|821
4V5G|1|DA|U|822
*
4V5G|1|DA|A|835
4V5G|1|DA|G|836
*
4V5G|1|DA|U|943
4V5G|1|DA|G|944
4V5G|1|DA|A|945
4V5G|1|DA|G|946
*
4V5G|1|DA|C|971
4V5G|1|DA|G|972
4V5G|1|DA|A|973
4V5G|1|DA|G|974
4V5G|1|DA|C|975
4V5G|1|DA|G|975|||A
4V5G|1|DA|C|976
4V5G|1|DA|G|977
4V5G|1|DA|G|978
4V5G|1|DA|G|979
4V5G|1|DA|A|980
4V5G|1|DA|A|981
4V5G|1|DA|C|982
4V5G|1|DA|A|983
4V5G|1|DA|A|984
4V5G|1|DA|C|985
4V5G|1|DA|C|986
4V5G|1|DA|G|987
4V5G|1|DA|A|988
4V5G|1|DA|G|989
4V5G|1|DA|A|990
4V5G|1|DA|C|991
*
4V5G|1|DA|G|1163
4V5G|1|DA|G|1164
*
4V5G|1|DA|C|1185
4V5G|1|DA|G|1186
4V5G|1|DA|G|1187
4V5G|1|DA|U|1188
4V5G|1|DA|A|1189
4V5G|1|DA|G|1190

Current chains

Chain DA: 23S RIBOSOMAL RNA

Nearby chains

Chain D3: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30
Chain D8: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L35
Chain DB: 5S ribosomal RNA; 5S rRNA
Chain DP: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15
Chain DU: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L20
Chain DV: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L21

J6_4V5G_002