J6_6ZTJ_001

3D structure

PDB id

6ZTJ (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

E. coli 70S-RNAP expressome complex in NusG-coupled state (38 nt intervening mRNA)

Experimental method

ELECTRON MICROSCOPY

Resolution

3.4 Å

Loop

Sequence

GG*CGAAC*GGAAAAGAAAU*AGAUU*AGCAG*CUAAAUAC

Length

36 nucleotides

Bulged bases

6ZTJ|1|BA|A|223

QA status

Valid loop

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

6ZTJ|1|BA|G|45
6ZTJ|1|BA|G|46
*
6ZTJ|1|BA|C|179
6ZTJ|1|BA|G|180
6ZTJ|1|BA|A|181
6ZTJ|1|BA|A|182
6ZTJ|1|BA|C|183
*
6ZTJ|1|BA|G|214
6ZTJ|1|BA|G|215
6ZTJ|1|BA|A|216
6ZTJ|1|BA|A|217
6ZTJ|1|BA|A|218
6ZTJ|1|BA|A|219
6ZTJ|1|BA|G|220
6ZTJ|1|BA|A|221
6ZTJ|1|BA|A|222
6ZTJ|1|BA|A|223
6ZTJ|1|BA|U|224
*
6ZTJ|1|BA|A|231
6ZTJ|1|BA|G|232
6ZTJ|1|BA|A|233
6ZTJ|1|BA|U|234
6ZTJ|1|BA|U|235
*
6ZTJ|1|BA|A|262
6ZTJ|1|BA|G|263
6ZTJ|1|BA|C|264
6ZTJ|1|BA|A|265
6ZTJ|1|BA|G|266
*
6ZTJ|1|BA|C|426
6ZTJ|1|BA|U|427
6ZTJ|1|BA|A|428
6ZTJ|1|BA|A|429
6ZTJ|1|BA|A|430
6ZTJ|1|BA|U|431
6ZTJ|1|BA|A|432
6ZTJ|1|BA|C|433

Current chains

Chain BA

23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain B4

50S ribosomal protein L34