Loop J6_7AZY

3D structure

PDB id: 7AZY (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: Context-specific inhibition of eukaryotic translation by macrolide antibiotics
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 2.877 Å

Loop

Sequence: GAGUAC*GGAAAAGAAAC*GGAUU*AAAAG*CUAAAUAUUGG*CAUC
Length: 42 nucleotides
Bulged bases: 7AZY|1|E|A|67, 7AZY|1|E|U|329, 7AZY|1|G|U|34
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

7AZY|1|E|G|22
7AZY|1|E|A|23
7AZY|1|E|G|24
7AZY|1|E|U|25
7AZY|1|E|A|26
7AZY|1|E|C|27
*
7AZY|1|E|G|58
7AZY|1|E|G|59
7AZY|1|E|A|60
7AZY|1|E|A|61
7AZY|1|E|A|62
7AZY|1|E|A|63
7AZY|1|E|G|64
7AZY|1|E|A|65
7AZY|1|E|A|66
7AZY|1|E|A|67
7AZY|1|E|C|68
*
7AZY|1|E|G|75
7AZY|1|E|G|76
7AZY|1|E|A|77
7AZY|1|E|U|78
7AZY|1|E|U|79
*
7AZY|1|E|A|106
7AZY|1|E|A|107
7AZY|1|E|A|108
7AZY|1|E|A|109
7AZY|1|E|G|110
*
7AZY|1|E|C|321
7AZY|1|E|U|322
7AZY|1|E|A|323
7AZY|1|E|A|324
7AZY|1|E|A|325
7AZY|1|E|U|326
7AZY|1|E|A|327
7AZY|1|E|U|328
7AZY|1|E|U|329
7AZY|1|E|G|330
7AZY|1|E|G|331
*
7AZY|1|G|C|32
7AZY|1|G|A|33
7AZY|1|G|U|34
7AZY|1|G|C|35

Current chains

Chain E: 25S ribosomal RNA
Chain G: 5.8S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain D: 60S ribosomal protein L35-A
Chain R: 60S ribosomal protein L15-A
Chain d: 60S ribosomal protein L36-A
Chain g: 60S ribosomal protein L37-A
Chain k: 60S ribosomal protein L13-A
Chain p: 60S ribosomal protein L4-A

J6_7AZY_001