J6_8QBT_001
3D structure
- PDB id
- 8QBT (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
- Description
- E. coli ApdP-stalled ribosomal complex
- Experimental method
- ELECTRON MICROSCOPY
- Resolution
- 2.2 Å
Loop
- Sequence
- GG*CGAAC*GGAAAAGAAAU*AGAUU*AGCAG*CUAAAUAC
- Length
- 36 nucleotides
- Bulged bases
- 8QBT|1|A|A|223
- QA status
- Valid loop
Sequence variability
-
If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.
- R3DSVS
Structural variability across Equivalence Class
-
The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.
- R3DMCS EC
Structural variability across Rfam
-
If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.
- R3DMCS Rfam
- Detailed Annotation
- No text annotation
- Broad Annotation
- No text annotation
- Motif group
- Not in a motif group
- Basepair signature
- Not available
- Number of instances in this motif group
- 0
Unit IDs
8QBT|1|A|G|45
8QBT|1|A|G|46
*
8QBT|1|A|C|179
8QBT|1|A|G|180
8QBT|1|A|A|181
8QBT|1|A|A|182
8QBT|1|A|C|183
*
8QBT|1|A|G|214
8QBT|1|A|G|215
8QBT|1|A|A|216
8QBT|1|A|A|217
8QBT|1|A|A|218
8QBT|1|A|A|219
8QBT|1|A|G|220
8QBT|1|A|A|221
8QBT|1|A|A|222
8QBT|1|A|A|223
8QBT|1|A|U|224
*
8QBT|1|A|A|231
8QBT|1|A|G|232
8QBT|1|A|A|233
8QBT|1|A|U|234
8QBT|1|A|U|235
*
8QBT|1|A|A|262
8QBT|1|A|G|263
8QBT|1|A|C|264
8QBT|1|A|A|265
8QBT|1|A|G|266
*
8QBT|1|A|C|426
8QBT|1|A|U|427
8QBT|1|A|A|428
8QBT|1|A|A|429
8QBT|1|A|A|430
8QBT|1|A|U|431
8QBT|1|A|A|432
8QBT|1|A|C|433
Current chains
- Chain A
- 23S rRNA
Nearby chains
- Chain c
- Large ribosomal subunit protein bL34
Coloring options: