J6_8QPP_001

3D structure

PDB id

8QPP (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

Bacillus subtilis MutS2-collided disome complex (stalled 70S)

Experimental method

ELECTRON MICROSCOPY

Resolution

3.4 Å

Loop

Sequence

GC*GCAGAC*GGAAGAGAAAG*CGAUU*AUCAG*CUAAAUAC

Length

37 nucleotides

Bulged bases

8QPP|1|X|G|184, 8QPP|1|X|A|226

QA status

Valid loop

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

8QPP|1|X|G|45
8QPP|1|X|C|46
*
8QPP|1|X|G|181
8QPP|1|X|C|182
8QPP|1|X|A|183
8QPP|1|X|G|184
8QPP|1|X|A|185
8QPP|1|X|C|186
*
8QPP|1|X|G|217
8QPP|1|X|G|218
8QPP|1|X|A|219
8QPP|1|X|A|220
8QPP|1|X|G|221
8QPP|1|X|A|222
8QPP|1|X|G|223
8QPP|1|X|A|224
8QPP|1|X|A|225
8QPP|1|X|A|226
8QPP|1|X|G|227
*
8QPP|1|X|C|234
8QPP|1|X|G|235
8QPP|1|X|A|236
8QPP|1|X|U|237
8QPP|1|X|U|238
*
8QPP|1|X|A|265
8QPP|1|X|U|266
8QPP|1|X|C|267
8QPP|1|X|A|268
8QPP|1|X|G|269
*
8QPP|1|X|C|473
8QPP|1|X|U|474
8QPP|1|X|A|475
8QPP|1|X|A|476
8QPP|1|X|A|477
8QPP|1|X|U|478
8QPP|1|X|A|479
8QPP|1|X|C|480

Current chains

Chain X

23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain 2

Large ribosomal subunit protein bL34

Chain b

Large ribosomal subunit protein uL4