3D structure

PDB id
8QK7 (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description
E167K RF2 on E. coli 70S release complex with UAA
Experimental method
ELECTRON MICROSCOPY
Resolution
2.77 Å

Loop

Sequence
CGACUAAG*UACAAGC*GAACUC*GUAC*GCGCUG*CC*GG
Length
35 nucleotides
Bulged bases
8QK7|1|1|C|2021
QA status
Valid loop

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.
R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.
R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.
R3DMCS Rfam
Detailed Annotation
No text annotation
Broad Annotation
No text annotation
Motif group
Not in a motif group
Basepair signature
Not available
Number of instances in this motif group
0

Unit IDs

8QK7|1|1|C|8
8QK7|1|1|G|9
8QK7|1|1|A|10
8QK7|1|1|C|11
8QK7|1|1|U|12
8QK7|1|1|A|13
8QK7|1|1|A|14
8QK7|1|1|G|15
*
8QK7|1|1|U|525
8QK7|1|1|A|526
8QK7|1|1|C|527
8QK7|1|1|A|528
8QK7|1|1|A|529
8QK7|1|1|G|530
8QK7|1|1|C|531
*
8QK7|1|1|G|2018
8QK7|1|1|A|2019
8QK7|1|1|A|2020
8QK7|1|1|C|2021
8QK7|1|1|U|2022
8QK7|1|1|C|2023
*
8QK7|1|1|G|2040
8QK7|1|1|U|2041
8QK7|1|1|A|2042
8QK7|1|1|C|2043
*
8QK7|1|1|G|2625
8QK7|1|1|C|2626
8QK7|1|1|G|2627
8QK7|1|1|C|2628
8QK7|1|1|U|2629
8QK7|1|1|G|2630
*
8QK7|1|1|C|2788
8QK7|1|1|C|2789
*
8QK7|1|1|G|2894
8QK7|1|1|G|2895

Current chains

Chain 1
23S rRNA

Nearby chains

Chain C
Large ribosomal subunit protein uL3
Chain J
Large ribosomal subunit protein uL13
Chain Q
50S ribosomal protein L20
Chain S
50S ribosomal protein L22
Chain b
50S ribosomal protein L32

Coloring options:

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