Loop J8_4V5G

3D structure

PDB id: 4V5G (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: The crystal structure of the 70S ribosome bound to EF-Tu and tRNA
Experimental method: X-RAY DIFFRACTION
Resolution: 3.6 Å

Loop

Sequence: AGCCGAUGAAG*CGAAUG*CG*CAC*GGGGGAAC*GGAGAGGAAAGAGAAAUCGACU*ACCAG*CUAAGUACU
Length: 66 nucleotides
Bulged bases: 4V5G|1|DA|U|50, 4V5G|1|DA|A|223, 4V5G|1|DA|A|229
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

4V5G|1|DA|A|43
4V5G|1|DA|G|44
4V5G|1|DA|C|45
4V5G|1|DA|C|47
4V5G|1|DA|G|48
4V5G|1|DA|A|49
4V5G|1|DA|U|50
4V5G|1|DA|G|51
4V5G|1|DA|A|52
4V5G|1|DA|A|53
4V5G|1|DA|G|54
*
4V5G|1|DA|C|116
4V5G|1|DA|G|117
4V5G|1|DA|A|118
4V5G|1|DA|A|119
4V5G|1|DA|U|120
4V5G|1|DA|G|121
*
4V5G|1|DA|C|130
4V5G|1|DA|G|131
*
4V5G|1|DA|C|148
4V5G|1|DA|A|149
4V5G|1|DA|C|150
*
4V5G|1|DA|G|176
4V5G|1|DA|G|177
4V5G|1|DA|G|178
4V5G|1|DA|G|179
4V5G|1|DA|G|180
4V5G|1|DA|A|181
4V5G|1|DA|A|182
4V5G|1|DA|C|183
*
4V5G|1|DA|G|214
4V5G|1|DA|G|215
4V5G|1|DA|A|216
4V5G|1|DA|G|217
4V5G|1|DA|A|218
4V5G|1|DA|G|219
4V5G|1|DA|G|220
4V5G|1|DA|A|221
4V5G|1|DA|A|222
4V5G|1|DA|A|223
4V5G|1|DA|G|224
4V5G|1|DA|A|225
4V5G|1|DA|G|226
4V5G|1|DA|A|227
4V5G|1|DA|A|228
4V5G|1|DA|A|229
4V5G|1|DA|U|230
4V5G|1|DA|C|231
4V5G|1|DA|G|232
4V5G|1|DA|A|233
4V5G|1|DA|C|234
4V5G|1|DA|U|235
*
4V5G|1|DA|A|262
4V5G|1|DA|C|263
4V5G|1|DA|C|264
4V5G|1|DA|A|265
4V5G|1|DA|G|266
*
4V5G|1|DA|C|426
4V5G|1|DA|U|427
4V5G|1|DA|A|428
4V5G|1|DA|A|429
4V5G|1|DA|G|430
4V5G|1|DA|U|431
4V5G|1|DA|A|432
4V5G|1|DA|C|433
4V5G|1|DA|U|434

Current chains

Chain DA: 23S RIBOSOMAL RNA

Nearby chains

Chain D7: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34
Chain DP: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L15
Chain DX: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L23

J8_4V5G_004