Loop J8_8QPP

3D structure

PDB id: 8QPP (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: Bacillus subtilis MutS2-collided disome complex (stalled 70S)
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.4 Å

Loop

Sequence: AAGUUAGAAAG*UACAAGU*AUAGUA*UUAC*GCGCAG*CCAU*AGUAAG*CGAGGACU
Length: 52 nucleotides
Bulged bases: 8QPP|1|X|G|576, 8QPP|1|X|G|2050
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

8QPP|1|X|A|5
8QPP|1|X|A|6
8QPP|1|X|G|7
8QPP|1|X|U|8
8QPP|1|X|U|9
8QPP|1|X|A|10
8QPP|1|X|G|11
8QPP|1|X|A|12
8QPP|1|X|A|13
8QPP|1|X|A|14
8QPP|1|X|G|15
*
8QPP|1|X|U|571
8QPP|1|X|A|572
8QPP|1|X|C|573
8QPP|1|X|A|574
8QPP|1|X|A|575
8QPP|1|X|G|576
8QPP|1|X|U|577
*
8QPP|1|X|A|2047
8QPP|1|X|U|2048
8QPP|1|X|A|2049
8QPP|1|X|G|2050
8QPP|1|X|U|2051
8QPP|1|X|A|2052
*
8QPP|1|X|U|2069
8QPP|1|X|U|2070
8QPP|1|X|A|2071
8QPP|1|X|C|2072
*
8QPP|1|X|G|2654
8QPP|1|X|C|2655
8QPP|1|X|G|2656
8QPP|1|X|C|2657
8QPP|1|X|A|2658
8QPP|1|X|G|2659
*
8QPP|1|X|C|2817
8QPP|1|X|C|2818
8QPP|1|X|A|2819
8QPP|1|X|U|2820
*
8QPP|1|X|A|2831
8QPP|1|X|G|2832
8QPP|1|X|U|2833
8QPP|1|X|A|2834
8QPP|1|X|A|2835
8QPP|1|X|G|2836
*
8QPP|1|X|C|2914
8QPP|1|X|G|2915
8QPP|1|X|A|2916
8QPP|1|X|G|2917
8QPP|1|X|G|2918
8QPP|1|X|A|2919
8QPP|1|X|C|2920
8QPP|1|X|U|2921

Current chains

Chain X: 23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain 0: 50S ribosomal protein L32
Chain a: Large ribosomal subunit protein uL3
Chain e: Large ribosomal subunit protein uL13
Chain n: Large ribosomal subunit protein bL20
Chain r: Large ribosomal subunit protein uL22

J8_8QPP_002