Loop HL_8GHU

3D structure

PDB id: 8GHU (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: Methyltransferase RmtC bound to the 30S ribosomal subunit
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3 Å

Loop

Sequence: GGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCC
Length: 69 nucleotides
Bulged bases: 8GHU|1|a|A|702, 8GHU|1|a|U|723
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

8GHU|1|a|G|669
8GHU|1|a|G|670
8GHU|1|a|G|671
8GHU|1|a|U|672
8GHU|1|a|A|673
8GHU|1|a|G|674
8GHU|1|a|A|675
8GHU|1|a|A|676
8GHU|1|a|U|677
8GHU|1|a|U|678
8GHU|1|a|C|679
8GHU|1|a|C|680
8GHU|1|a|A|681
8GHU|1|a|G|682
8GHU|1|a|G|683
8GHU|1|a|U|684
8GHU|1|a|G|685
8GHU|1|a|U|686
8GHU|1|a|A|687
8GHU|1|a|G|688
8GHU|1|a|C|689
8GHU|1|a|G|690
8GHU|1|a|G|691
8GHU|1|a|U|692
8GHU|1|a|G|693
8GHU|1|a|A|694
8GHU|1|a|A|695
8GHU|1|a|A|696
8GHU|1|a|U|697
8GHU|1|a|G|698
8GHU|1|a|C|699
8GHU|1|a|G|700
8GHU|1|a|U|701
8GHU|1|a|A|702
8GHU|1|a|G|703
8GHU|1|a|A|704
8GHU|1|a|G|705
8GHU|1|a|A|706
8GHU|1|a|U|707
8GHU|1|a|C|708
8GHU|1|a|U|709
8GHU|1|a|G|710
8GHU|1|a|G|711
8GHU|1|a|A|712
8GHU|1|a|G|713
8GHU|1|a|G|714
8GHU|1|a|A|715
8GHU|1|a|A|716
8GHU|1|a|U|717
8GHU|1|a|A|718
8GHU|1|a|C|719
8GHU|1|a|C|720
8GHU|1|a|G|721
8GHU|1|a|G|722
8GHU|1|a|U|723
8GHU|1|a|G|724
8GHU|1|a|G|725
8GHU|1|a|C|726
8GHU|1|a|G|727
8GHU|1|a|A|728
8GHU|1|a|A|729
8GHU|1|a|G|730
8GHU|1|a|G|731
8GHU|1|a|C|732
8GHU|1|a|G|733
8GHU|1|a|G|734
8GHU|1|a|C|735
8GHU|1|a|C|736
8GHU|1|a|C|737

Current chains

Chain a: 16S rRNA

Nearby chains

Chain f: 30S ribosomal protein S6, non-modified isoform
Chain o: 30S ribosomal protein S15
Chain r: 30S ribosomal protein S18

HL_8GHU_035