Loop IL_6GZX

3D structure

PDB id: 6GZX (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: T. thermophilus hibernating 100S ribosome (ice)
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 4.57 Å

Loop

Sequence: GGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCU*AGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACC
Length: 53 nucleotides
Bulged bases: 6GZX|1|A1|G|299, 6GZX|1|A1|G|300, 6GZX|1|A1|G|306, 6GZX|1|A1|A|308, 6GZX|1|A1|C|312, 6GZX|1|A1|C|317, 6GZX|1|A1|G|377, 6GZX|1|A1|G|378, 6GZX|1|A1|G|379, 6GZX|1|A1|G|386, 6GZX|1|A1|U|387
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

6GZX|1|A1|G|291
6GZX|1|A1|G|292
6GZX|1|A1|G|293
6GZX|1|A1|C|294
6GZX|1|A1|C|295
6GZX|1|A1|C|296
6GZX|1|A1|U|297
6GZX|1|A1|C|298
6GZX|1|A1|G|299
6GZX|1|A1|G|300
6GZX|1|A1|A|301
6GZX|1|A1|C|302
6GZX|1|A1|A|303
6GZX|1|A1|C|304
6GZX|1|A1|C|305
6GZX|1|A1|G|306
6GZX|1|A1|A|307
6GZX|1|A1|A|308
6GZX|1|A1|U|309
6GZX|1|A1|C|310
6GZX|1|A1|C|311
6GZX|1|A1|C|312
6GZX|1|A1|C|313
6GZX|1|A1|A|314
6GZX|1|A1|G|315
6GZX|1|A1|C|316
6GZX|1|A1|C|317
6GZX|1|A1|U|318
*
6GZX|1|A1|A|372
6GZX|1|A1|G|373
6GZX|1|A1|G|374
6GZX|1|A1|U|375
6GZX|1|A1|G|376
6GZX|1|A1|G|377
6GZX|1|A1|G|378
6GZX|1|A1|G|379
6GZX|1|A1|G|380
6GZX|1|A1|G|381
6GZX|1|A1|A|382
6GZX|1|A1|U|383
6GZX|1|A1|A|384
6GZX|1|A1|G|385
6GZX|1|A1|G|386
6GZX|1|A1|U|387
6GZX|1|A1|G|388
6GZX|1|A1|A|389
6GZX|1|A1|G|390
6GZX|1|A1|G|391
6GZX|1|A1|G|392
6GZX|1|A1|U|393
6GZX|1|A1|A|394
6GZX|1|A1|C|395
6GZX|1|A1|C|396

Current chains

Chain A1: 23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain T1: 50S ribosomal protein L24
Chain W1: 50S ribosomal protein L28

IL_6GZX_199