Loop IL_7ACJ

3D structure

PDB id: 7ACJ (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: Structure of translocated trans-translation complex on E. coli stalled ribosome.
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3.2 Å

Loop

Sequence: AUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGG*CCACCCUUUAAUGUUUGAU
Length: 47 nucleotides
Bulged bases: 7ACJ|1|1|U|2106, 7ACJ|1|1|G|2110, 7ACJ|1|1|U|2111, 7ACJ|1|1|G|2112, 7ACJ|1|1|U|2113, 7ACJ|1|1|A|2114, 7ACJ|1|1|G|2115, 7ACJ|1|1|G|2116, 7ACJ|1|1|U|2118, 7ACJ|1|1|G|2120, 7ACJ|1|1|A|2176, 7ACJ|1|1|C|2177, 7ACJ|1|1|C|2178, 7ACJ|1|1|U|2180, 7ACJ|1|1|U|2181
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

7ACJ|1|1|A|2097
7ACJ|1|1|U|2098
7ACJ|1|1|U|2099
7ACJ|1|1|G|2100
7ACJ|1|1|A|2101
7ACJ|1|1|G|2102
7ACJ|1|1|C|2103
7ACJ|1|1|C|2104
7ACJ|1|1|U|2105
7ACJ|1|1|U|2106
7ACJ|1|1|G|2107
7ACJ|1|1|A|2108
7ACJ|1|1|U|2109
7ACJ|1|1|G|2110
7ACJ|1|1|U|2111
7ACJ|1|1|G|2112
7ACJ|1|1|U|2113
7ACJ|1|1|A|2114
7ACJ|1|1|G|2115
7ACJ|1|1|G|2116
7ACJ|1|1|A|2117
7ACJ|1|1|U|2118
7ACJ|1|1|A|2119
7ACJ|1|1|G|2120
7ACJ|1|1|G|2121
7ACJ|1|1|U|2122
7ACJ|1|1|G|2123
7ACJ|1|1|G|2124
*
7ACJ|1|1|C|2174
7ACJ|1|1|C|2175
7ACJ|1|1|A|2176
7ACJ|1|1|C|2177
7ACJ|1|1|C|2178
7ACJ|1|1|C|2179
7ACJ|1|1|U|2180
7ACJ|1|1|U|2181
7ACJ|1|1|U|2182
7ACJ|1|1|A|2183
7ACJ|1|1|A|2184
7ACJ|1|1|U|2185
7ACJ|1|1|G|2186
7ACJ|1|1|U|2187
7ACJ|1|1|U|2188
7ACJ|1|1|U|2189
7ACJ|1|1|G|2190
7ACJ|1|1|A|2191
7ACJ|1|1|U|2192

Current chains

Chain 1: 23S ribosomal RNA

Nearby chains

Chain G: 50S ribosomal protein L9

IL_7ACJ_201