Loop IL_8GHU

3D structure

PDB id: 8GHU (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: Methyltransferase RmtC bound to the 30S ribosomal subunit
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 3 Å

Loop

Sequence: UAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGC*GAGGAAGGUG
Length: 56 nucleotides
Bulged bases: 8GHU|1|a|U|1122, 8GHU|1|a|U|1126, 8GHU|1|a|C|1136, 8GHU|1|a|A|1146, 8GHU|1|a|C|1147, 8GHU|1|a|U|1148, 8GHU|1|a|C|1149, 8GHU|1|a|A|1151, 8GHU|1|a|A|1152, 8GHU|1|a|C|1158, 8GHU|1|a|U|1183
QA status: Unknown status

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

8GHU|1|a|U|1116
8GHU|1|a|A|1117
8GHU|1|a|U|1118
8GHU|1|a|C|1119
8GHU|1|a|C|1120
8GHU|1|a|U|1121
8GHU|1|a|U|1122
8GHU|1|a|U|1123
8GHU|1|a|G|1124
8GHU|1|a|U|1125
8GHU|1|a|U|1126
8GHU|1|a|G|1127
8GHU|1|a|C|1128
8GHU|1|a|C|1129
8GHU|1|a|A|1130
8GHU|1|a|G|1131
8GHU|1|a|C|1132
8GHU|1|a|G|1133
8GHU|1|a|G|1134
8GHU|1|a|U|1135
8GHU|1|a|C|1136
8GHU|1|a|C|1137
8GHU|1|a|G|1138
8GHU|1|a|G|1139
8GHU|1|a|C|1140
8GHU|1|a|C|1141
8GHU|1|a|G|1142
8GHU|1|a|G|1143
8GHU|1|a|G|1144
8GHU|1|a|A|1145
8GHU|1|a|A|1146
8GHU|1|a|C|1147
8GHU|1|a|U|1148
8GHU|1|a|C|1149
8GHU|1|a|A|1150
8GHU|1|a|A|1151
8GHU|1|a|A|1152
8GHU|1|a|G|1153
8GHU|1|a|G|1154
8GHU|1|a|A|1155
8GHU|1|a|G|1156
8GHU|1|a|A|1157
8GHU|1|a|C|1158
8GHU|1|a|U|1159
8GHU|1|a|G|1160
8GHU|1|a|C|1161
*
8GHU|1|a|G|1175
8GHU|1|a|A|1176
8GHU|1|a|G|1177
8GHU|1|a|G|1178
8GHU|1|a|A|1179
8GHU|1|a|A|1180
8GHU|1|a|G|1181
8GHU|1|a|G|1182
8GHU|1|a|U|1183
8GHU|1|a|G|1184

Current chains

Chain a: 16S rRNA

Nearby chains

Chain c: 30S ribosomal protein S3
Chain g: 30S ribosomal protein S7

IL_8GHU_056