J4_3Q1Q_001

3D structure

PDB id

3Q1Q (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)

Description

Structure of a Bacterial Ribonuclease P Holoenzyme in Complex with tRNA

Experimental method

X-RAY DIFFRACTION

Resolution

3.8 Å

Loop

Sequence

AC*GCAAG*CGCUUGAG*CCCAGAUUGAUGACCGCCCACGACAGAAU

Length

44 nucleotides

Bulged bases

3Q1Q|1|B|A|222, 3Q1Q|1|B|A|276, 3Q1Q|1|B|C|298, 3Q1Q|1|B|U|303, 3Q1Q|1|B|G|304, 3Q1Q|1|B|A|305, 3Q1Q|1|B|U|306, 3Q1Q|1|B|C|313, 3Q1Q|1|B|C|314, 3Q1Q|1|B|A|315, 3Q1Q|1|B|C|316, 3Q1Q|1|B|G|317

QA status

Valid loop

Sequence variability

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give its sequence variability.

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

The link below will give the loop's structural variability across the equivalence class for this chain.

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

If this chain is mapped to an Rfam alignment, the link below will give the loop's structural variability between chains mapped to the same Rfam family.

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation

No text annotation

Broad Annotation

No text annotation

Motif group

Not in a motif group

Basepair signature

Not available

Number of instances in this motif group

0

Unit IDs

3Q1Q|1|B|A|57
3Q1Q|1|B|C|58
*
3Q1Q|1|B|G|220
3Q1Q|1|B|C|221
3Q1Q|1|B|A|222
3Q1Q|1|B|A|223
3Q1Q|1|B|G|224
*
3Q1Q|1|B|C|270
3Q1Q|1|B|G|271
3Q1Q|1|B|C|272
3Q1Q|1|B|U|273
3Q1Q|1|B|U|274
3Q1Q|1|B|G|275
3Q1Q|1|B|A|276
3Q1Q|1|B|G|277
*
3Q1Q|1|B|C|296
3Q1Q|1|B|C|297
3Q1Q|1|B|C|298
3Q1Q|1|B|A|299
3Q1Q|1|B|G|300
3Q1Q|1|B|A|301
3Q1Q|1|B|U|302
3Q1Q|1|B|U|303
3Q1Q|1|B|G|304
3Q1Q|1|B|A|305
3Q1Q|1|B|U|306
3Q1Q|1|B|G|307
3Q1Q|1|B|A|308
3Q1Q|1|B|C|309
3Q1Q|1|B|C|310
3Q1Q|1|B|G|311
3Q1Q|1|B|C|312
3Q1Q|1|B|C|313
3Q1Q|1|B|C|314
3Q1Q|1|B|A|315
3Q1Q|1|B|C|316
3Q1Q|1|B|G|317
3Q1Q|1|B|A|318
3Q1Q|1|B|C|319
3Q1Q|1|B|A|320
3Q1Q|1|B|G|321
3Q1Q|1|B|A|322
3Q1Q|1|B|A|323
3Q1Q|1|B|U|324

Current chains

Chain B

RNase P RNA

Nearby chains

Chain A

Ribonuclease P protein component

Chain C

TRNA (PHE)