Loop J4_8QCQ

3D structure

PDB id: 8QCQ (explore in PDB, NAKB, or RNA 3D Hub)
Description: B. subtilis ApdA-stalled ribosomal complex
Experimental method: ELECTRON MICROSCOPY
Resolution: 2.3 Å

Loop

Sequence: CUGGC*GCGUGAGUGAUGAAGGUUUUCGGAUCGUAAAGCUCUGUUGUU*AACCAGAAAG*CAAG
Length: 61 nucleotides
Bulged bases: 8QCQ|1|a|U|429
QA status: Valid loop

Sequence variability

R3DSVS

Structural variability across Equivalence Class

R3DMCS EC

Structural variability across Rfam

R3DMCS Rfam

Detailed Annotation: No text annotation
Broad Annotation: No text annotation
Motif group: Not in a motif group
Basepair signature: Not available
Number of instances in this motif group: 0

Unit IDs

8QCQ|1|a|C|38
8QCQ|1|a|U|39
8QCQ|1|a|G|40
8QCQ|1|a|G|41
8QCQ|1|a|C|42
*
8QCQ|1|a|G|410
8QCQ|1|a|C|411
8QCQ|1|a|G|412
8QCQ|1|a|U|413
8QCQ|1|a|G|414
8QCQ|1|a|A|415
8QCQ|1|a|G|416
8QCQ|1|a|U|417
8QCQ|1|a|G|418
8QCQ|1|a|A|419
8QCQ|1|a|U|420
8QCQ|1|a|G|421
8QCQ|1|a|A|422
8QCQ|1|a|A|423
8QCQ|1|a|G|424
8QCQ|1|a|G|425
8QCQ|1|a|U|426
8QCQ|1|a|U|427
8QCQ|1|a|U|428
8QCQ|1|a|U|429
8QCQ|1|a|C|430
8QCQ|1|a|G|431
8QCQ|1|a|G|432
8QCQ|1|a|A|433
8QCQ|1|a|U|434
8QCQ|1|a|C|435
8QCQ|1|a|G|436
8QCQ|1|a|U|437
8QCQ|1|a|A|438
8QCQ|1|a|A|439
8QCQ|1|a|A|440
8QCQ|1|a|G|441
8QCQ|1|a|C|442
8QCQ|1|a|U|443
8QCQ|1|a|C|444
8QCQ|1|a|U|445
8QCQ|1|a|G|446
8QCQ|1|a|U|447
8QCQ|1|a|U|448
8QCQ|1|a|G|449
8QCQ|1|a|U|450
8QCQ|1|a|U|451
*
8QCQ|1|a|A|500
8QCQ|1|a|A|501
8QCQ|1|a|C|502
8QCQ|1|a|C|503
8QCQ|1|a|A|504
8QCQ|1|a|G|505
8QCQ|1|a|A|506
8QCQ|1|a|A|507
8QCQ|1|a|A|508
8QCQ|1|a|G|509
*
8QCQ|1|a|C|554
8QCQ|1|a|A|555
8QCQ|1|a|A|556
8QCQ|1|a|G|557

Current chains

Chain a: 16S rRNA

Nearby chains

Chain c: Small ribosomal subunit protein uS3
Chain l: 30S ribosomal protein S12

J4_8QCQ_012